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科技服务

产品名称

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产品描述

空间转录组测序

 

Strand-Specific RNA Sequencing

链特异性转录组测序

链特异性录组测序(Strand-Specific RNA Sequencing)是指在构建测序文库时,利用Illumina高保真Tag酶将mRNA链的方向信息保存到测序文库中。测序后的数据分析可确定转录本是来自正义还是反义DNA链。与普通转录组测序相比,它更能准确地统计转录本的数量和确定基因的结构,同时可以发现更多的反义转录本,目前被广泛地应用于研究基因结构和基因表达调控等领域范围。

 

 

Long Noncoding RNA,IncRNA

长链非编码

长链非编码RNA(Long Noncoding RNA,IncRNA)是指长度在200-100000nt之间不具有蛋白编码功能的RNA分子。它们存在带polyA尾和不带polyA尾两形式,具有跨物种的低保守性,组织特异性表达和丰度低等特点。lncRNA的种类远远超过编码RNA,保守估计哺乳动物基因组序列中4%-9%的序列产生lncRNA转录本,而相应的蛋白编码RNA的比例仅是1%-5%。目前研究提示lncRNA的功能机制主要包括参与转录调控、转录后调控、蛋白质运输和mRNA降解。lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点,借助高通量测序,研究人员能够快速获得与疾病或者特定生物学过程相关的lncRNA并进行深入研究

 

 

环状RNA测序

环状RNA测序是新兴的转录组测序技术。过去普遍认为细胞内的非编码RNA多以线型存在,近年来越来越多的研究发现,环状RNA在哺乳动物细胞内的表达量远高于普遍认识水平。环状RNA可以参与基因的表达调控,例如封闭miRNA的作用、调节本位基因的表达等,是长链非编码RNA研究中的一个新的研究热点。

 

 

small RNA测序

small RNA是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用,包括miRNA、piRNA和siRNA,晶能生物公司可以提供各类small RNA的测序服务(miRNA、piRNA、siRNA)。

 

 

新物种de novo转录组测序

新物种de novo转录组测序是指不依赖于任何已知转录组序列信息对某个物种的转录组进行测序,然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装,最终获得该物种转录组序列图谱。

 
 

新物种均一化cDNA文库测序

均一化cDNA文库是指某一特定组织或细胞的所有表达基因均包含其中,且在cDNA文库中表达基因对应的cDNA的拷贝数相等或接近。构建均一化的cDNA文库的主流方法是基于基因组DNA在拷贝数上具有相对均一化的性质,通过cDNA与基因组DNA饱和杂交而降低在文库中高拷贝存在的cDNA的丰度;均一化处理后文库的高丰度表达 cDNA 是处理前的0.3%~2.5%,基本满足节约筛选的要求。

 

 

单细胞测序

 

中国首批提供单细胞测序专业服务

 

10X Genomics

单细胞转录组测序

单细胞水平的高通量基因表达谱分析,对复杂细胞群体深入分析,表征单个细胞的表达谱。可同时检测CRISPR干扰、细胞表面蛋白,避免单个细胞的异质性生物学信息被大量细胞的均质化掩盖。

 

 

10X Genomics

单细胞免疫谱测序

可同时检测单细胞转录组及B细胞、T细胞的多样性。通过Feature Barcoding技术,还可检测细胞表面蛋白和抗原特异性,加速对适应性免疫反应的研究和理解。

10x Genomics 利用5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行T细胞和B细胞的V(D)J富集,从而实现高通量的单细胞转录组测序和成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)的全长测序。为免疫组库全面、系统的研究提供了高效的技术平台,对疾病发生、发展的分子机制研究有重要的意义。

 

 

10X Genomics Chromium Single Cell ATAC Solution

单细胞scATAC-seq

在解决细胞异质性的同时,研究表观遗传学调控机制,同时结合motif分析来识别参与基因表达调控的转录因子,是单细胞表观遗传学的重要突破。单细胞基因组染色质可接近性分析。

10x Genomics Chromium Single Cell ATAC Solution(10x scATAC-seq)是在单细胞表观基因组学水平上揭示染色质可接近性的研究策略。通过单细胞染色质可接近性图谱构建,不仅能清晰了解染色质结构,还可以绘制高分辨率转录因子调控网络,为深入了解疾病的诊断和治疗铺平道路。

 

 

10X Genomics

单细胞CNV分析

一次捕获上千个细胞,在单细胞DNA水平检测CNV和罕见克隆。

 

 

10X Genomics

基因组测序

10x基因组测序可提供超长片段的全基因组信息,进行突变检出、单倍体分型和基因组结构鉴定。能够揭示遗传性疾病的关键变异,并发现与癌症相关的易感位点。

 

 

高通量测序

 

拥有测序龙头企业illumina公司最新NovaSeq 60003台、HiSeq2台、MiSeq 1台。可覆盖不同类型客户的不同测序需求

 

可提供服务:

  • 单细胞测序服务
  • 基因组层次研究服务
  • 转录组层次研究服务
  • 表观遗传学研究服务

 

基因芯片

 

自动化仪器配备;全面的芯片种类;超高的芯片检测通量和数据质量

 

Illumina基因分型芯片服务

  • Infinium Global Screening Array-24(GSA)(一款多种族的全基因组芯片)
  • Infinium Asia Screening Array-24(ASA)(一款专为东亚人群设计的高通量基因分型芯片)
  • Infinium Chinese Genotyping Array-24(CGA)(一款专为中国人群设计的科研级芯片)
  • Infinium OmniZhonghua-8 Beadchip(一款专为中国人设计的全基因组SNP基因分型芯片)
  • Infinium CytoSNP-850K Beadchip(一款用于检测体制异常或肿瘤的芯片)

 

 

Illumina 人 DNA甲基化芯片服务

  • Infinium Methylation EPIC Beadchip (850K甲基化芯片)

人类的许多疾病(包括癌症)都是由于异常的甲基化引起的。为了检测基因组的甲基化 ,加速甲基化研究的发展,提升研究效率,lllumina 推出了高通量的450k甲基化芯片。为研究者提供了一个更经济可靠的甲基化研究平台。

 

 

Illumina 小鼠 DNA甲基化芯片服务

  • Infinium Mouse Methylation BeadChip 

目前全世界已培育了超过20万种改造的小鼠品系,其中大多被用来进行模拟人类疾病研究 ,因此拥有广泛的应用方向,如进行表观基因组关联分析(EWAS) 、肿瘤异种移植模型研究、临床前研究、毒理学研究、发育生物学研究等,凡是以DNA甲基化为基础的研究,均可以使用lnfinium Mouse Methyla­tion BeadChip 来开展验证性工作。

 

生物信息分析服务

 

高通量技术的广泛使用,产生了海量的实验数据。

如何从繁复庞大的实验数据中挖掘出具有生物学意义的结果,已成为研究人员日益关心的问题。

 

平台优势服务:

  • 技术支持:强大的生物信息专家团队,曾自主研发多项分析软件,发表多篇论文。
  • 硬件建设:拥有的超大计算集群为高性能的数据处理与安全的数据储存提 供了硬件保障。
  • 项目经验丰富:拥有丰富的数据分析经验,用户使用相关数据已有众多文章发表。
  • 一对一服务

 

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